Cambiar la seguridad de un fichero

Hola a todos, estoy tratando de ejecutar en red un ejecutable ( tambien hecho
por mi ) que se encuentra dentro de una red local. Le hago la llamada dentro
de un programa realizado en c#.

El fichero no me deja ejecutarlo por problemas de seguridad del ensamblado.
Si le cambio la seguridad con el ConfigWizards.exe me deja ejecutarlo.

Existe alguna manera de realizar esto mediante codigo, o de alguna otra
manera para que no me de fallo de seguridad.

Muchas gracias.