DFS

Buenos días tengo una duda bastante urgente,
tengo montado un servicio de DFS, entre varios servidores, pero he tenido
un
problema con 2 de ellos, la replica dejo de funcionar, y en la consola de
DFS
estaba habilitada las dos referencias de dfs, con lo cual si las rutas a
replicar eran:

\\server1\carpetas referencia habilitada
\\server2\carpetas referencia habilitada.

resulta que habia usuarios conectados a server1 y otros a server2, y como
la
replica no funcionaba cuando el que habia estado conectado a server1 se
conectaba a server2 no veia todos sus ficheros.

ahora parece que la replica a empezado a funcionar, y he desabilitado una
de
las referencias para que los usuarios me vayan siempre a un mismo servidor
a
sus carpetas compartidas.
Pero me encuentro que los ficheros que ya están direrentes en las dos
carpetas, no se como van a quedar, tengo por ejemplo un usuario que tiene
una
carpeta en server1 que no existe en server2, y otra en server2 que no
existe
en server1, cuando replique que hara? me creará en server2 la que le falta
de
server1 y en server1 la que le falta de server2?, o me borrará las dos
carpetas?

Gracias de antemano