lentitud de programa

Hola grupo
A ver si lo explico bien y me entendeis:
Se trata de un concesionario de coches que tiene 2 sucusales con 2 redes
conectadas por adsl.
El caso es que tienen un programa en el pc servidor, con una base de datos
donde tienen todos los datos de todos los clientes. A este programa acceden
tanto los Pc que están en la misma red (en el mismo pueblo) y los Pc que
están en la otra red (otro pueblo). Estos últimos acceden por terminal
services al programa anterior. Ambas redes funcionan perfectamente y se
comunican a las milñ maravillas através de la ADSL. El caso es que usando el
ghost y el sysprep, se han hecho varios clones de un Pc de la red donde está
el programa en cuestión y se han dejado unos Pc en dicha red y otros se han
llevado `para la otra red. en dichos clones se han configurado las Ip,
puertas de enlace y dns correspondientes.
El problema viene ahora:
Hay dos equipos (clones) que a la hora de ejecutar el programa en cuestión,
el acceso y funcionamiento de dicho programa se hace muy lento.
Sólo es Lentitud no problema de ejecución.
Porqué sucede esto?????
Todos los Pc clonados vienen del mismo origen y son COMPLETAMENTE IGUALES.
Alguna sugerencia?????
Mil gracias