No arranca perfiles posible virus?

Buenas noches:

He tenido un problema con un sistema operativo al no arrancar este por
problemas de perdida de archivos en la carpeta C:\Windows\System
Me he decidido a salvar los datos del hdd dañado y montarlo como
esclavo, al hacer esto ... el sistema operativo del 2º equipo SE LO
CARGA... de tal manera que al entrar con cualquier perfil incluso el de
administrador argumenta que "No se ha encontrado perfil y no se
localiza perfil local", para cerciorarme de que esto no fuera un
problema puntual decidi hacerlo en un pc con el WinXP pelado y aun asi
me volvio a petar

Decido arrancar una 3ª maquina (por si las moscas) en modo a prueba de
fallos y sacar los dichosos datos y al montarla nuevamente en el equipo
final ... este vuelve cargarse el sistema operativo pues EN TODOS LOS
CASOS aun desconectando el disco "infectado" y volviendo a iniciar...
no logra recuperar perfil alguno.

Estoy algo perdido pues no se ciertamente que sea un virus y si lo es
... pienso que es de gran magnitud pues hasta la fecha no he visto
virus alguno que puesto en un disco como esclavo logre infectar un
equipo a prueba de fallos y lo peor ... no he visto .exe, .com sospecho
en el disco supuestamente infectado.

Para dar alguna pista el visor de sucesos dice que las unidades del
disco infectado tienen el mismo ID que las unidades locales y procede a
cambiar una serie de parametros ... si se precisan mas detalles los
proporcionare.