Nombre duplicado en windows server

Hola a

tengo un servidor que tenia 2000 server y lo hemos actualizado a 2003
server
En el sistema Aaparece un nombre para el 2003
y aparece otro nombre para anteriores a windows 2000 con otro nombre
distinto que es contra el que valida los equipos cliente
los clientes no los valida con el nombre del dominio de 2003 server

¿podria unificar los 2 nombres?
o como me puedo validarme contra el dominio 2003

Gracias
Miguel