Organización sistema de ficheros

Hola a todos,
Tengo una duda que estoy segura tiene fácil solución, pero no acierto a
encontrarla, y es la siguiente: He organizado los discos y carpetas de datos
de manera que les sea fácilmente "entendibles" a los distintos usuarios. El
problema es que esta organización que a los usuarios les gusta tanto, a mi
me da muchos problemas con la administración de permisos y gpo's.
Existe alguna manera de organizar el file system como a mi me convenga a
nivel de permisos y tal, y poner "por encima una especia de capa lógica" de
manera que los usuarios vean las carpetas como quieren, sin que les importe
en qué disco están, ni de que manera, etc?

Algo he leido de DFS pero no se si esa seria la solución.
Muchísimas gracias,

Farners