Problema al ejecutar programas

Tengo un equipo con Windows 2000 y me ha entrado un virus que ya he
localizado y limpiado, tras esto me seguían sin funcionar bien todas
aquellas
aplicaciones que necesitaban del NTVDM, he mirado varios comentarios
al
respecto y tras hacer todo lo que en estos ponía como solución
(revisar
win.ini, system. ini, autoexec.nt, config.nt, etc copiar ficheros al
system
etc) me seguía sin funcionar el equipo, he decidido actualizar a
Windows xp
el sist. op. tras esto he notado alguna mejoría ya que ahora si que me
deja
ejecutar el sysedit y el edit en una ventana de comando, pero siguen
sin
funcionarme todas aquellas aplicaciones que son de 16 bits, el error
que me
pone ahora es "programa demasiado extenso para colocarlo en memoria",
ya no
se que más puedo hacer ya que no puedo formatear este equipo ya que
tiene
programas valiosos que no tengo los fuentes para poderlos reinstalar.

También me han desaparecido los iconos de muchos de los programas
quedando
el fondo transparente, así como alguna ventana del propio sistema
operativo.

Agradezco de corazón cualquier información al respecto.
Gracias de antemano.
Alejandro.