problemas con DNS AD y subredes

Hola a todos, tengo un problema en el dominio y es que los equipos no se
registran debidamente en el dns y por tatno en el AD.
Todos mis routers son ciscos y mis sucursales se conectan por una punto a
punto.
Hay configurado un parámetro que es el helper en el router que permite que
cada sucursal coja su DHCP específico, pero no funciona correctamente el
DNS.
¿hay alguna manera de configurar esto? cada sucursal tiene otro
direccionamiento ip y no todos deberían de funcionar con los controladores
de
dominio locales.
No tengo problemas ni con exchange ni con terminal server, pero la
validación de AD no funciona

Gracias por anticipado y un saludo!