abrir 2 bases paralelas

HOla, tengo un pequeño problema, tengo 2 bases de datos, una local y otra en
un servidor, y necesito vaciar el contenido de la tabla del servidor en la
base de datos local, abro 2 conexiones y todo bien, pero cuando ejecuto el
command me toma solo la ultima conexion
Si hago esto mismo con 2 bases de datos locales me funciona correctamente,
pero al hacerlo, como lo indico anteriomente, me dice que la ultima tabla de
la primera conexion no existe.

Gracias por su ayuda