Servidor de Ficheros

Hola a todos y todas. Espero que me podais ayudar. Tengo un servidor en el
que los usuarios y usuarias van almacenando información a la cual acceden
grupos de personas, ya sabeis, lo tipico, unos con lectura, otros para
escritura, etc. El caso es que esa estrucutra de carpetas se me esta
complicando mucho y cada vez que tengo que asignar un permiso se hace una
tarea tediosa. MI pregunta es ¿Existe alguna herramienta, manual, o lo que
sea que me facilite esa tarea?. ¿Que herramienta (SO) es la ideal para
esto
de compartir archivos?.

Voy a migrar todos los datos a un nuevo servidor en breve, este es el
momento para cambiar, asi que por favor, ayudadme un poquito.

Gracias.