Macros se duplican

hola, carlos !

... archivo ... varias macros ... por cada presupuesto un nuevo archivo.
... cuando abro dos archivos de presupuesto, al tener ambos las mismas macros
... ejecutar una ... no se ejecuta en el libro activo sino en su similar que se encuentra abierto.

una [posible] solucion ya te la apunta Cesar [aunque 'invirtio' los terminos, la idea 'es valida'] ;)
- 'hacer referencia' [en las macros] a la hoja 'activa' [y/o 'del libro activo'] p.e.
ActiveSheet o... ActiveWorkbook.Worksheets(2) o... [...]

otra 'posibilidad' [si ejecutas las macros desde herramientas / macros ... o {Alt}+{F8}] es:
- 'seleccionar' la macro 'de cual libro' quieres que se ejecute.

otra posibilidad es que las estes 'llamando' desde figuras o botones [de formularios] 'incrustados' en la/s hoja/s...
- en este caso, las macros [en los objetos 'shape'] 'quedan vinculadas' al libro 'original' =>antes del 'guardar como...'<
¿comentas datos adicionales?
saludos,
hector.