Consulta timeout de un Stored Procedure

Tengo un problemilla que debe ser algo sencillo, pero no sé como
resolverlo:

Ejecuto un proceso como un trabajo con el agente de sql server, lo que se
ejecuta es un stored procedure que en el asistente de consultas tarda un
poco mas de 2 horas. Pero al ejecutarlo desde el agente me da timeout. El
tema es que es un proceso que necesito que se ejecute todas las noches.

Alguien sabe como evitar el timeout en estos casos?

Muchas gracias,
Pablo