Problemas al iniciar Windows

Hola, tengo un PC con dos HD. En uno de ellos tengo instalado Windows Vista
(esclavo o secundario) y en el otro Windows XP Pro SP3 totalmenete
actualizado (maestro o primario).

Mi problema es que desde hace unas semanas el PC tarda muchísimo en arrancar
Windows XP, incluso a veces no consigo que se incie. He probado en modo
seguro a prueba de fallos, y le he pasado el antivirus (AVG) y el Spyboot
pero nada de esto ha servido. Otra cosa que ha ocurrido es que el
administrador de discos de Windows no detecta el HD esclavo donde tengo
Windos Vista, cosa que sí hacía antes. He intentado modificando el disco de
arranque en la BIOS para que lo hiciera desde Windows Vista pero no lo
reconoce y tampoco puedo arrancar desde el otro HD donde está Windows Vista

Me han comentado que el problema es del HD o de algún virus que no detecta
mi antivirus. Perdón por el crosspost pero estoy ya desesperado con este
problema. Si alguien tiene alguna idea sobre este tema le agradecería
enormemente que me ayudase.

Saludos,

Sebastián