SSL

Hola. Llevo bastante tiempo trabajando en una aplicación de comercio
electrónico. Prácticamente terminada y subida al servidor, solo me queda
esperar que instalen el certificado para que algunas de las página se
puedan llamar a traves de https. Me gustaría saber como funciona una
aplicación web con certificado porque me temo que voy a tener problemas.
Por lo que he leído, una vez instalado el certificado para mi aplicación,
la única diferencia que hace que una página se vea a traves de un canal
seguro o no es si en la url se pone https o http. Yo mismo, internamente
controlo que ciertos enlaces sean a direcciones seguras de esa forma.
Alguien podría decirme si estoy en lo cierto o me equivoco, o si hay
diferentes formas de instalr un certificado que me pudieran dar
complicaciones..

Gracias y perdon por enrollarme tanto;)