Theads que duren hasta despues de la vida de una aplicacion!!!!!

Hola, primeramente queria agradecerles su ayuda de antemano.
No se si es posible lo que quiero hacer, resulta que tengo una aplicacion
que al conectarse lanza un hilo y hace que se descargue un archivo de una dir
ftp, hasta ahi todo bien, lo unico es que la descarga del archivo le lleva
una hora aprox. pero si yo termino mi aplicacion antes de ese tiempo de
descarga el archivo no se termina de descargar, se queda a mitad.
Mi cuetion es: ¿Existe alguna manera posible de que el hilo de ejecucion
dure incluso despues de que termine mi aplicación?
O sino es posible acepto cualquier otra valiosa idea.
Muchas gracias.
Salu2.