Error con nombre de dominio

Hola a todos y de antemano gracias por su ayuda

mm.. por donde empezar. Instale un server 2003 como DC y cometi el error de
poner como nombre de dominio el de la empresa, tengo levantado el servidor
DNS en el mismo servidor.

Mi problema es que ahora cuando intento accesar a la pagina de la empresa
(que tiene como direccion www.nombreempresa.com) el explorador me marca un
error de que no puede encontrar la pagina (Este error lo marca solo cuando
tengo configurado el DNS Primario en los equipos apuntando a mi servidor DNS,
si pongo los de mi ISP no tengo problema)

Lo malo es que si pongo los DNS de mi ISP tengo muchos problemas para que
los equipos se firmen y accedan a las aplicaciones que estan en la red.

Alguna idea de como solucionar este problema?

Gracias de antemano.