Permisos servidor de ficheros

Hola buenos días, en mi organización tenemos en el DC principal (W2000
Adcanced Server) un almacenamiento externo que sirve de servidor de
ficheros
corporativo para todos los usuarios.

Vamos a migrar de máquina (a una más potente) y a Windows Server 2003
dicho
servidor y el problema es que no sabemos como mantener-migrar toda la
jerarquía de permisos que tiene cada carpeta-subcarpeta del servidor de
ficheros.

Es decir, cuando vinculemos el almacenamiento externo a la nueva máquina
migrada habremos perdido todos esos permisos??

Es para nosotros muy importante no perder la estructura de permisos
asignada
actualmente.

Muchas gracias y saludos.