Actualizar base de datos

hola a todos:
Tengo crreada una aplicacion. Esta aplicacion esta instalada en un
servidor
web de tal empresa, y despues tenemos otro servidor para la base de datos.
En esta empresa no esta la ultima version de la aplicacion, y por tanto
quizas falten campos de alguna que otra tabla, los procedimientos
almacenados se hayan cambiado...Nosotros tnemos la ultima version y
actualizarla.Pero teniendo en cuenta que hay campos nuevos en la tabla,
como
podemos hacer para que al restaurar la base de datos esos datos reales
introducidos en la base de datos de ls empres no desaparezcan.
Gracias y espero que me puedan ayudar