Como comparo imagenes rapidamente!

Tengo un probelma, antes usaba net 2003 y me funcionaba rapidamente la
exploracion de imagenes como matrices pixel a pixel (comparaba cada uno de
los pixeles de la imagen 1 con los de la 2, despues contaba cuantos pixeles
diferentes habia y segun eso miraba si la imagen era diferente o 'parecida'),
pero me pase a 2005 y este codigo se me demora el doble de tiempo, si alguien
sabe, por favor, ¿Hay alguna manera mas rapida de comparar imagenes, que me
permita un rango de error o que me diga por cuanto es diferente?

Gracias,
Programar... es mucho mas que codificar