Enfoque???

Hola a todos, de antemano mil gracias por leer este post
no se si alguien de ustedes ha tenido este mismo problema
pero si alguien me pudiera ayudar se los agradeceria, mi
pregunta es la siguiente, tengo una aplicacion de tipo
linea de comandos que manda a llamar a una DLL de Windows,
el problema es que si la ejecuto dandole doble click, me
funciona bien pero si la mando a llamar desde otra
aplicacion no funciona, casi al momento que se abre se
cierra pero si le doy doble click a la aplicacion funciona
bien...sabe alguien la forma de hacer que al ejecutarse
nuestra aplicacion no pierda el enfoque ni se oculte ni
nada de eso sino hasta que se cierre...???

de antemano mil gracias...
Saludos a todos...!!! desde Chetumal Quintana Roo México.