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¿Por que en windos vista no funcionan las apliaciones que tenia en XP?

Les pregunto por que, intente instalar una aplicacion que tengo en XP en
vista y manda errores de que no puede ejecutarse, y despues probe con una
version de la aplicacion para windows 2000 y esta si la instalo bien, y se
ejecuta de maravilla.

Aque se debera que la vercion de windows 2000 si funciona en vista y la
version de windows XP no funciona en vista.

¿Que tan seguro es que este ejecutando la vercion windows 2000 en vista?
¿Podria haber perida de informacion por ejecutar la vercion de la
apliacacion de windows 2000 en vista?