W2003 Server no consigo meterlo dentro del dominio

Tenemos una intranet con un servidor en w2000 que hace de servidor de
dominio
y hemos añadido otro servidor que hace de servidor de archivos en w2003
server. Mi problema es que no consigo meterlo en el dominio para poder
compartir una carpeta y poder dar más o menos permisos a los usuarios de
ese
dominio.
Me dice bienvenido al dominio pero requiere reiniciar y no es reconocido
como equipo dentro del dominio xq a la hora de dar permisos solo me deja a
los usuarios locales de la máquina. ¿Que puedo hacer?...