Archivos no ejecutables

Bueno, no sé si éste es el mejor sitio para publicar esto, pero espero que me
puedan ayudar. Tube un problema con un disco duro, y me pedía que formateara
una serie de particiones. Con el software adecuado recuperé los archivos de
las carpetas a las que no podía acceder. El problema está en que hay una
serie de archivos que no los puedo ejecutar. Tienen un tamaño correcto, la
apariencia la tienen como si estubieran bien, pero al ejecutarlos el programa
con el que se abren me dice que no sabe como leerlos. Creo recordar que
algunos de estos archivos, al ponerlos en una carpeta concreta, se veían.
Llegué a la conclusión que necesitaban estar en la misma ruta en la que
estaban antes de el problema con el disco duro, pero de todas formas no sé
cómo puedo solucionarlo con todos los que ahora no se pueden ver.
Me pueden ayudar? gracias!