Dns no funciona con DHCP instalado

Buenos dias a todos, mi problema es el siguiente:
Tengo dos controladores de DNS que son Domain Controllers. Desde el comienzo
funcionaron bien, todos los equipos resolvian bien los nombres. Pero hace 2
meses instalamos DHCP, y desde entonces ciertos equipos fallan al resolver
nombres, y lo mas raro es que la solucion que hemos encontrado, es cambiar
los DNS's de orden (en la config. de red de cada pc que falle ponemos los
DNS's de forma manual, es decir, que no los coja por DHCP, y como dns
primario el que estaba secundario y viceversa).
Hemos comprobado varias veces el estado y la configuracion del DHCP y del
DNS y no hay nada raro. Espero que me podais ayudar.
Postdata: no todos los pc's que cogen la red por DHCP fallan al resolver
nombres.

Muchas gracias, un saludo