Error de GPO en equipos clonados

BUenas a todos,
HE comprobado que en los ultimos equipos no se ejecutaban todas las gpo y he llegado a la conclusion que son un nuevo lote de pcs que se estan clonando de un disco duro master.
Buscando he visto que esta la herramienta sysprep pero que se ha de usar antes de clonar los equipos. Aun asi lo he probado y no me ha servido para nada.
Lo curioso es que algunas gpo si que las coge , pero no la mayoria. Evidentemente, probe con el mismo user en una maquina antigua y si que se ejecutan. Todos los equipos estan en una misma UO, y las gpo son nivel usuario.
Saludos y gracias