"problema" al conectar disco externo usb

Hola

Tengo un disco duro externo usb de 60 GB, con interfaz USB 2.0 y el usb de
la placa tiene la version 1.1.
El tema es que cuando conecto el disco este se queda como "pillao" con la
luz que indica que esta leyendo encendida durante 2 minutos!! y no puedo
utilizar ningun programa que tenga que algo con el explorador de windows,
aunque si utilizar los que estan arrancados (siempre que no tengan que ver
con el explorador). Al cabo de los dos minutos Windows se entera
definitivamente que tiene un disco duro mas, le asigna una letra y ya se
puede trabajar con el.
Si arranco con el disco conectado, llega un momento que la pantalla se queda
en negro y pasan esos dos minutos, con el disco "leyendo" y luego todo
normal

Sin embargo, cuando conecto el disco estando en linux, este tiempo no pasa
ni se queda la unidad leyendo por periodo de 2 minutos, 1 ó 5 segundos, sino
que es montarlo y trabajar con el.

Entonces... ¿el lapsus de tiempo en windows a qué es debido? ¿hace algun
chequeo o escaneo del disco cuando se conecta?

Muchas gracias.