Problema con defrag

Hola grupo.
No encontré info en la base de conocimiento de microsoft, así que
pregunto aquí.
Tengo un disco de 40 GB particionado de modo que la primaria es de 2
GB y la secundaria de 36 GB aprox, la partición primaria fue
desfragmentada con éxito.
Mi problema es que al tratar de desfragmentar la secundaria el
defrag llega al 3% del 'Buscando errores en la unidad' y vuelve a
empezar. He corrido scandisk en DOS y no encuentra nada, si corro el de
windows reinicia cuando llega a la 'C' del botón cancelar (3/4 de la
partición aprox. Ninguno de los dos programas me da ningún mensaje de error.
Si alguien tiene alguna idea de qué puede estar pasando le
agradeceré muchísimo.
Saludos a todos.

-= Nicolás Conde - SS.AA. =-
-= Facultad de Ingeniería =-
-= Universidad de la República =-