Problemas aplicación GPOs tras migración a Windows 2003

Hola a todos. Acabamos de migrar un dominio Windows 2000 a Windows
2003. En principio todo parece haber ido bien, salvo algunas
directivas de grupo que han dejado de funcionar. En concreto, las
directivas problemáticas lo que hacen es lanzar ficheros BAT al
arrancar/apagar los equipos o iniciar/cerrar las sesiones. En los
ficheros BAT se ejecuta un programa que se encuentra en una carpeta
compartida del controlador de dominio y se referencia mediante una
ruta UNC. El error que se produce en los clientes es el siguiente.

"CMD.EXE se inició con esta ruta como el directorio actual. No se
permiten rutas UNC. Regresando de manera predeterminada al directorio
Windows"

En Windows 2000 nos funcionaba perfectamente. ¿Hay alguna forma de
hacer que esto vaya en Windows 2003?

Gracias de antemano.