Aplicacion de ACLs

Hola

Estoy intentando aplicar ACLs en carpetas a traves de la herramienta
XCACLS de las Support Tools de Server 2003 con la opción /e
(edición). Luego de aplicarlas, cuando intento acceder a la pestaña
SEGURIDAD de esa carpeta, me aparece un cuadro de advertencia diciendo
que los permisos están desordenados y que si no se ordenan todo puede
ir mal. Qué pasó? Cómo puedo hacer para solucionarlo? Tengo
alguna otra forma de aplicar ACLs a través de scripts y que no me
ocurra eso? Existe alguna otra herramienta de linea de comando
alternativa?

Gracias

Gonza