Error 55. La estructura del disco está dañada.

Hola. Administro un servidor HP con RAID 1 y W2003 server. Hubo un problema
con el RAID que se solucionó simplemente sacando y volviendo a poner los
discos.
A los dos días ha habido problemas de escritura en la partición E: de datos.
He programado un chkdsk /f, y al reiniciar y comenzar el escaneo aparecen
errores tales como: error en índice $O del archivo 25, y no acaba el escaneo,
así que cada vez que se reinicia vuelve a realizar el chkdsk. Mi pregunta es
si solucionaría el problema formateando la partición. Todos los test del RAID
de HP son correctos.
Gracias