Quitar Puntos de Restauración

He tenido algunos virus/spyware y he decidido quitar los puntos de
restauración anteriores tras limpiar al sistema.
Al abrir la herramienta Liberador de Espacio de Disco esta se queda
calculando el espacio que puede conseguir comprimiendo archivos antiguos.
Ya lleva 30 minutos con solo 3 rayas de progreso y la CPU al 100%
Cleanmgr.exe está al 99% y parece que está trabajando, pero no hay actividad
en el disco duro.
Incluso cancelando la operación el proceso cleanmgr.exe sigue a tope.

Cómo resuelvo esto?
Hace poco que desfragmenté la unidad, por si tuviera algo que ver.

Gracias y un saludo