Error en instalacion en contexto...

Hola grupo tengo el Pc saturado y quiero hacer una instalacion
en contexto para reemplazar archivo y copiar algunos que faltan.
Mi problema es que hay archivos que me da error al copiar, no
se cuales son porque me salen bastantes voy cancelando hasta que
acaba la instalacion.
En el primer reinicio despues de la instalacion tarda muchisimo
en
arrancar, " la verdad es que no se si arranca porque lo reinicio
manualmente ".
Luego en marcha va bastante lento, peor que antes de hacer la
instalacion.

Me podeis ayudar, lo ultimo que haria es el formateo, tengo
muchas contraseñas de foros, y no se como guardarlas para luego
no tener que ir registrandome de nuevo, algunas las podria
perder
para siempre y dos programas que he perdido el cd de
instalacion

En el caso de formatear que debo de tener en cuenta para ir
guardando este tipo de archivos, para posibles fallos en un
futuro, se pueden guardar ? como ?


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Muchisimas gracias por adelantado

Gracias por contestar.
La instalacion que he llevado a cabo es el apartado nº 2
reiniciando el equipo, probare la opcion 1ª.
La instalacion en contexto ya la he realizado en un par de
ocasiones y siempre me ha ido a la perfeccion, sin perdida de
datos, esta vez no se que le puede pasar que no funciona, hay
archivos que no me copia.
Lo he probado con 2 S.O. uno con SP2 y otro sin y no hay
manera.
Esperare a mas posibles soluciones.

Muchas gracias