Instalar 2 sistemas operativos con boot magic

Hola tengo 2 particiones con un windows xp y un windows 2003 server que me
arrancan con la tipica pantalla negra en la que me deja elegir cual arrancar.
Mi problema es que al intentar cambiar este arranque por un arranque con el
boot magic, solo m aparece el sistema operativo de windows xp ya que segun
tengo entendido necesito que en ambas particiones se instalen los archivos
ntldr y demas... y en la 2ª particion no se me instalan ya que para el inicio
con boot.ini no es necesario, ¿que puedo hacer?