Problemas de clonacion

Buenas tardes y Felices Pascuas.
Mi problema es el siguiente, recientemente he configurado un nuevo servidor
(como maestro de infraestructura) en una sede remota asi brevemente el
esquema de mi empresa es:

server w2000 sp4 como maestro de operaciones dominioX misma
sede
server w2003 sp2 como maestro de infraestsructura dominioX misma
sede
server 2003R2 sp1 como maestro de infraestructura cominioX
Distinta sede
Lo cierto es que a raíz de la instalación de este nuevo servidor comenze a
tener problemas en la autentificacion de los usuarios. Si entro en "DOMINIOS
Y CONFIANZA, en la opcion de Maestro de operaciones" del servidor remoto, me
da un mensaje que pone:
"MAESTRO DE OPERACIONES NO CONECTADO", no se puede transferir la función.
cosa que no deberia pasar, entiendo que hay algún problema pero el active
directory del servidor remoto refleja la estructura con usuario y OU del
servidor remoto.
¿ Se os ocurre el porque?
Otra cosa, Los DNS de los usuarios remotos están apuntando al servidor
remoto, es decir al que se encuentra en su ubicación.

Si no es pedir demasiado, tambien me gustaria que me dijerais si seria mejor
opción disponer de un nuevo DOMINIO en la sede remota y establecer relaciones
de confianza o esta opción que yo he implementado.
¿que pasaría si por un problema de conexión el servidor remoto no conectara?
¿se podrian loguear los usuarios y trabajar normalmente en la red?

Perdonad la extensión del post y mil gracias por leerlo.