"Reinicie [...] o introduzca disco [...]"

Tengo tres discos en el sistema.
Tuve un pequeño problema y no me arrancaba Windows así que reinstalé
el
sistema, pero al hacerlo, el disco de instalación de 160 Gb. sólo
reconocía
137 Gb. (finalmente seguí el consejo de fermu y se solventó; tenía el
atapi.sys desfasado).
El caso es que mientras solventaba ese problema, reinstalé en limpio
el XP,
en otro disco y mantuve deshabilitado el disco de 160 por si me daba
problemas [es un SATA; por si tiene algo que ver] (todavía reconocía
únicamente 137).
El caso, más complejo de lo que parece inicialmente, es que aún cuando
instalé en este disco, que el sistema reconció como e: (c: el SATA que
comentaba, y d: otro que tengo como trastero y para juegos), y todo
fue
perfectamente, al habilitar el disco c:, ya con el atapi actualizado y
su
capacidad al completo, y vuelvo a arrancar el ordenador, me da el
mensaje que
os mencioné: "Reinicie el sistema o introduzca disco de sistema y
pulse una
tecla".
De momento estoy arrancando con un disco de sistema sin problemas (en
a:),
pero me gustaría ver si me podéis ayudar a reconfigurar el arranque
desde
disco duro.
Una cosa más. Ya de otra instalación anterior (la primera que hice en
el
disco de 160) los archivos boot, ntdetect, ntldr y demás me los cargó
en el
disco d: (el de trastero y juegos). Hasta que tuve el problemilla
mencionado
al principio esto no supuso ningún problema (el sistema estaba cargado
en c:
y el disco de arranque parecía ser el d:) ¡Vaya cacao!
En fin, muchas gracias, si no os habéis cansado de leer antes de
llegar
aquí, y os parece posible echarme una mano.