Reinstalacion de SO

Que tal.

Tengo una duda y es la siguiente, tengo un equipo con
Sistema Operativo Win NT WorkStation y el sistema esta
dañado al parecer del registro, si quisiera hacer una
reinstalacion del sistema operativo desde un cd de booteo
¿perderia toda la informacion y programas instalados? lo
pregunto ya que con win98 lo he hecho y reinstala el
sistema operativo y me deja intacto las aplicaciones que
ya esta instaladas.
En su defecto que puedo hacer si el sistema operativo
esta dañado tal vez del registro y no quiero perder las
aplicaciones que ya esta instaladas.
No tengo discos ERD y ya intente entrar atraves de la
consola y darle un chkdsk pero no hacen nada.

Espero sus valiosos comentarios.

Saludos.
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